Ideas para conmemorar el día del ADN

 Bioquímica, Bioquímica, Célula, Célula, Ciencias del mundo contemporáneo, científicos, Citología e Histología, Genética, Genética  Sin comentarios »
Abr 252015
 

Hoy, 25 de abril se conmemora el descubrimiento de la estructura del ADN por Watson y Crick,  basado también en el trabajo de Rosalind Franklin, de la que el día 16 hizo 57 años de su muerte.
Algunas curiosidades:

  • Si multiplicamos la longitud del DNA de una célula por todas las células del ser humano, haríamos 70 viajes de ida/vuelta al sol.
  • ¿Sabías que el ADN te influye a la hora de escoger pareja?
  • El ADN contiene más información en un centímetro cúbico que un millón de millones de Compact Discs
  • Sí “estirásemos” el ADN de cada célula alcanzaríamos una longitud de 2 metros
  • Si estirásemos el ADN de todas las células de nuestro cuerpo, con su longitud ¡podríamos dar más de 1.500 vueltas al planeta!
  • 1 millon de bases(Megabases) de DNA es el equivalente a 1 Megabyte de almacenamiento en un pc
  • El ADN mitocondrial sólo se hereda de la madre.
  • Si nuestro genoma fuese un libro y se leyesen 10 letras por segundo ¡tardaríamos 11 años en leerlo!
  • Sabías que si pusiésemos todo el ADN de un ser humano en línea recta llegaría a Plutón.
  • El helecho indio tiene mas de 1000 pares de cromosomas mientras que el ser humano solo 23
  • ¿Sabías que para escribir todas las letras que forman el genoma humano harían falta más de 214 millones de tuits?
  • ¿Sabías que para escribir todas las letras que forman el genoma humano harían falta más de 214 millones de tuits?
  • Si multiplicamos la longitud del DNA de una célula por todas las células del ser humano, haríamos 70 viajes de ida/vuelta al sol.

¿Qué podemos hacer con los alumnos?

1. Al igual que se hace en el día del libro con El Quijote, se puede leer un capítulo del libro de Genoma, Matt Ridley. Es un libro que tiene 23 capítulos, uno por cada cromosoma y que elige un gen controvertido para discutir sobre lo que es genético o no. Das con ello pie a fomentar la lectura divulgativa, que no es poco, y  a la discusión: hasta donde llega la Ciencia, lo que hoy es verdad, mañana no lo es…

2. Recorta y pega del ADN: hay varios modelos.

http://cienciasnaturalesgtb.wikispaces.com/file/view/adn+1.pdf

http://es.scribd.com/doc/67760648/ADN-RECORTABLE

3. Lectura del texto original del descubrimiento: http://www.bioxeo.com/adn.htm

4. Trabaja con la línea de tiempo sobre la Historia del ADN: tarda bastante en bajar:

http://www.biologia.edu.ar/macromoleculas/macromedia/history.exe

5. Juega con el ADN.

Puedes construir una molécula http://learn.genetics.utah.edu/es/units/basics/builddna/

Traduce y transcribe un gen: http://learn.genetics.utah.edu/es/units/basics/transcribe/posteriormente, un gen.

6. Proyecto Genoma humano: http://www.genome.gov/25019879. Aquí te explican tambiéncómo se secuencia el ganoma: http://www.genome.gov/Edkit/flash/intro.html Tiene un montón de animaciones.

7. Puedes extraer ADN: http://learn.genetics.utah.edu/es/units/activities/extraction/

8. Revisa las animaciones sobre el ADN: http://www.elmundo.es/especiales/2003/02/salud/genetica/descifrar_la_vida.html

1. Lectura de “Hasta ahora se creía que las únicas moléculas capaces de contener y transferir información biológica eran el ADN y el ARN. Un equipo de científicos ha sintetizado en el laboratorio seis polímeros que también cumplen con las leyes de la herencia y, uno de ellos, con la evolución darwiniana.” Sigue leyendo
2. Dibuja, fabrica, fotografía ADN:
3. Visualiza este video: https://www.youtube.com/watch?v=VZ8GZRx5_Vk

ADN animation.gif
«ADN animation» por brian0918™ – Trabajo propio. Disponible bajo la licencia Dominio público vía Wikimedia Commons.

El microscopio virtual

 1º Bachillerato, Célula, Célula, Citología e Histología, Sin categoria, TIC  4 comentarios »
Abr 032015
 

En la enseñanza a distancia no podemos realizar prácticas conjuntamente el alumnado y los profesores. Sin embargo, es posible facilitarles que las realicen ellos, gracias a los magníficos microscopios virtuales de los que disponemos. Vamos a realizar una práctica virtual

Práctica de microscopía

1. Revisa las partes del microscopio. Utiliza para ello
http://www.udel.edu/biology/ketcham/microscope/scope.html
a. Familiarízate con él y sigue el tutorial. Ajusta los oculares (swicht views) hasta que veas una sóla imagen. Toca los botones dirigiéndolos hacia adelante o detrás.Enciende los interruptores. Mueve la pletina (la bandeja en la que se colocan las muestras)
b. Cuántos objetivos se encuentran en el microscopio virtual? ¿Cuáles son los números que aparecen en cada uno de los objetivos? ¿Sabes qué quieren decir?
c.Busca la muestra (arriba a la derecha) con la etiqueta “letra e”. Sigue el tutorial y utiliza los ajustes del microscopio para enfocar la “e” en cada uno de los objetivos. Para ello, recuerda:
1. Ajusta los oculares.
2. Mueve el tornillo macrométrico y posteriormente el micrométrico para enfocar.
3. Posteriormente, una vez bien enfocado, puedes pasar al siguiente objetivo. Dibuje la “e” tal y como aparece

De la web http://www.biologycorner.com/worksheets/microscope-virtual.html
d. Selecciona las otras muestras (haz clic en una diapositiva)
e. Visita el siguiente enlace y describe cada una de las muestras: http://www.biologycorner.com/microscope/

2.Vamos con este microscopio, muy sencillo, que ahora que ya conoces su manejo, vas a poder manipular para ver las imágenes que se te muestran: http://recursos.educarex.es/escuela2.0/Ciencias/Biologia_Geologia/Laboratorios_Virtuales_Biologia_Geologia/Microscopio_Virtual/ Tienes imágenes típicas, que se ven bastante bien.
E incluso, puedes en este otro lugar, ver estructuras muy sencillas, como quizás viste de niño y de paso, vas a repasar cómo se dice en inglés…

3. Una vez que hayas estudiado las partes, vas a ver las preparaciones que tienen preparada en la siguiente simulación: http://www.genmagic.net/fisica/pl1c.swf
Fíjate que puedes cambiar los objetivos, mover el espejo y mover el tornillo…
a) ¿Qué ves en la preparación 1? Obsérvala como en los casos posteriores con varios objetivos.
b) ¿Qué ves en la preparación 2?
c) ¿Qué ves en la preparación 3?
d) ¿Qué ves en la preparación 4?
e) ¿Qué ves en la preparación 5?
f) ¿Qué consigues al cambiar los objetivos?
g) ¿Qué consigues al mover el espejo?
h) ¿Y al mover el tornillo?
i) Intenta construir un microscopio y relaciona las partes:

4. Para ver las distintas células sanguíneas, vamos a la siguiente dirección:
http://griho2.udl.es/carles/medicina/contador.html
Aquí vamos a intentar contar los distintos tipos de células sanguíneas que aparecen en la muestra, igual que harían en un laboratorio de Hematología, ¿o no te acuerdas de lo que es Hematología?
5. Vamos a pasar al microscopio electrónico, viendo algunas de las muestras especificadas y ordenándolas en el sitio adecuado (en inglés, pero ahora te resultará muy sencillo)
6. Vamos a diferenciar muestras vegetales, animales y algunas bacterias, utilizando además distintos tipos de microscopios electrónicos: Puedes mover la platina, cambiar los objetivos…
7. Ahora sí, vamos con el mejor microscopio virtual. http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/magnifying/index.html
a. Busca la muestra de mitosis de cebolla y haz una captura de las distintas fases por las que pasa.
8. Vamos a ver microorganismos que aparecen en una gota de agua. Intenta descubrir cuál sería su movimiento:

9.Puedes ver imágenes al microscopio en http://www.mos.org/sln/SEM/index.html

Para primero de bachillerato, podemos ver preparaciones histológicas en
http://virtual.ujaen.es/atlas/
Para ver preparaciones de tejidos con distintas tinciones http://www.madrimasd.org/cienciaysociedad/taller/animaciones/neuro/principal.asp
Para segundo de bachillerato
1. Ahora sí, vamos con el mejor microscopio virtual. http://micro.magnet.fsu.edu/primer/virtual/magnifying/index.html
Repasa los tipos de microscopio virtual que hay e intenta explicar la diferencia con lo que has visto anteriormente.
Visita http://www.microscopyu.com/tutorials/flash/spectralprofiles/index.html
2. Puedes descargar alguno de los microscopios virtuales que tienes a continuación, para ver en casa las diferencias.
Programa de aplicación Java para microscopio virtual: http://virtual.itg.uiuc.edu/downloads/
Otro

Los problemas de genética.

 2º Bachillerato, 3º y 4º ESO, Genética, Genética  Sin comentarios »
Feb 202015
 

El tema de Genética debes comenzar a estudiarlo después de conocer la Meiosis, que explica la herencia de caracteres: debes tener en cuenta que los caracteres están por duplicado, uno en cada componente de las parejas de cromosomas.

Lee las leyes de Mendel.

1. Empieza con los problemas de 1 carácter. Son muy sencillos.

Resolución de problemas de genética de 1 carácter from Isabel Etayo on Vimeo.

A continuación, lee la 3ª ley de Mendel, que sirve para aprender a realizar los problemas de dos caracteres.

Problemas de 2 caracteres. Fácil from Isabel Etayo on Vimeo.

Estos son los más sencillos, después continúa con:

REsolución de problemas de genética de 2 caracteres. from Isabel Etayo on Vimeo.

Es importantísimo que vayas haciendo los problemas del libro. Problemas de herencia de los grupos sanguíneos:

La herencia de los grupos sanguíneos: problemas from Isabel Etayo on Vimeo.

Problemas de herencia ligada al sexo:

Problemas de genética ligados al sexo. from Isabel Etayo on Vimeo.

Problemas de herencia: http://popplet.com/app/#/537371

Haz los ejercicios del libro y recuerda que están resueltos en el aula virtual. Para repasar: http://www.librosvivos.net/smtc/homeTC.asp?TemaClave=1185 Puedes jugar también con los genes en : http://www.arrakis.es/~ibrabida/biologia.html

Puedes hacer más problemas

http://www.bioygeo.info/GeneticaBG4.htm

http://www.elcora.org/005_esobach/biologia/4eso/problemas_genetica_con_soluciones_2011.pdf

http://juanmaarguelles.files.wordpress.com/2010/11/28_problemas_resueltos1.pdf

Mitosis y meiosis.

 Célula, Célula, Citología e Histología, Genética  Sin comentarios »
Oct 092014
 

Después de ver la célula, nos toca ver sus funciones: nutrición, relación y reproducción. Para aclarar los conceptor de mitosis y meiosis, incluyo unos vídeos caseros explicativos, con algunas preguntas  sobre el tema.s.

La mitosis.

La meiosis.

Ejercicios

  1. ¿Cuántos cromosomas tienen las células somáticas y cuántas las sexuales?
  2. ¿Qué células realizan la mitosis y cuáles la meiosis?
  3. ¿Qué es el sobrecruzamiento que produce la recombinación de genes?
  4. ¿Qué nos aparecería en el ecuador de una célula en

-Metafase de la Mitosis

-Metafase I

-Metafase II?

  1. ¿Cuáles son las diferencias entre mitosis y meiosis?
  2. ¿Cuál es la división reduccional y por qué?
  3. ¿Qué mecanismo utilizará un ser unicelular para reproducirse?

 
Para resolver tus dudas y que puedas repasar estos conceptos, te adjunto las diferencias entre ambos procesos

Los seres vivos

 Célula  Sin comentarios »
Sep 232014
 

Empezamos el nuevo curso en Biología de tercero ESO.
Visualiza el siguiente video y contesta a las preguntas.

Los seres vivos from Isabel Etayo on Vimeo.

Cuestiones
1. Niveles de organización de los seres vivos
2. Cuáles son los principales bioelementos.
3. Diferencia entre bioelementos y biomolécula
4. Nombra los tipos de células
5. Completa el siguiente cuadro

20120923-204616.jpg

Dibujar moléculas

 Bioquímica, Bioquímica, TIC, Utilidades  Sin comentarios »
Feb 272013
 

Gracias a Mertxe J. Badiola, compañera de En la nube TIC, he conocido Chemitorium una herramienta libre que permite visualizar y construir fácilmente moléculas.

  • Soporta  los siguientes formatos: CHX, XML, JPG, TIFF, PNG, BMP, GIF, EMF, WMF, lo que la convierte en ideal para incrustar en un blog o unos apuntes de clase.
  • Dispone de versión portable.

¿Cómo funciona?

Una vez descargada desde la propia página, se instala. Está disponible ne inglés y alemán.

1. File>New para empezar una reacción o una molécula.

2. Empezar a escribir: para ello podemos elegir desde la tabla periódica. Damos clic en la pizarra, y aparece el elemento con 4 esquinas, con clic derecho podemos arrastrar el elemento para enlazarlo con el siguiente, pudiendo alargar los enlaces con la barra. En el momento en que enlazamos otro elemento, desaparece un electrón.

3. Se pueden previsualizar las moléculas, alargando después las moléculas.

4. Se pueden añadir efectos, entre ellos el movimiento.

chemitorium

En definitiva, una herramienta muy fácil de usar y muy dinámica.

Otras herramientas

A formular

Bioquímica

 Bioquímica, Bioquímica, TIC  Sin comentarios »
Ene 282013
 

Cuando comenzamos con la Bioquímica en 1º y 2º de bachiller, cunde el pánico. Resulta complicado comenzar, sobre todo si los de Química no han dado todavía la parte correspondiente, y después continuar, cuando llegamos a la esteroisomería. Existen muchos programas que lo facilitan, programas de gráficos moleculares, capaces de leer y presentar la estructura tridimensional. Vamos a trabajar con RasMol porque nos permite visualizar moléculas y también manipularlas. incluso a nivel atómico.
¿Cómo trabaja?
Básicamente, lo que hace RasMol, es leer un archivo que contiene la información estructural de la molécula (archivo PDB) y presentar en pantalla el modelo gráfico, como resultado de la localización de cada uno de los átomos de la molécula, sobre un plano de coordenadas cartesianas x,y,z y la construcción de la gráfica correspondiente. Nos permitirá:
Visualizar representaciones y modelos de la estructura química.
Rotar, desplazar y cambiar el tamaño de la representación en pantalla de la molécula.
Seleccionar y/o restringir segmentos específicos de la molécula tales como sitios activos,dominios de unión, ligados, cofactores, mutaciones, etc.
Exportar las representaciones o imágenes moleculares generadas en diferentes formatos gráficos como gif, ppm y bmp.
Construir animaciones moleculares.
¿Qué necesitamos?

Esta información está recogida del trabajo de http://www.accefyn.org.co/bioinfo/pdf/articulo-acad2.PDF

Como usuarios
Para manejar los archivos, nace CHIME, que un plug-in para navegadores que permite el manejo de archivos tipo PDB pero a nivel de WEB, como un visualizador molecular, ya que Chime permite fácilmente navegar por las diferentes propiedades de una molécula.

Manejo interactivo de la molécula durante la ejecución de los scripts o animaciones moleculares. Es posible cambiar la posición y el tamaño de la molécula, y hacerla rotar, utilizando únicamente los botones del mouse.
Aplicación de la mayor parte de comandos de RasMol a partir de un menú de herramientas emergente y no a partir de una Línea de comandos como en RasMol.
Posibilidad de incluir imagénes, textos, tablas, sonido, etc, permitiendo la generación dewebs mucho más atractivas para el usuario.
Facilidad en la edición y ejecución de los scripts. A diferencia de un script RasMol, en Chime es posible que el usuario lo ejecute parcialmente, y es posible repetir algún paso de la secuencia tantas veces como se estime necesario.

Los dos programas, RasMol y Chime, son simples visualizadores de moléculas, tienen limitaciones ya que fueron concebidos como herramientas educativas, es decir son simples
¨navegadores¨. Una herramienta que permite además de visualizar el analizar, o por lo menos llevar a cabo ciertos análisis básicos sobre estructuras proteicas es el SwissProt y otros programas que vienen especificados en la parte de abajo.

Actividad
Vamos a verlos y utilizar alguno de ellos.
1. Vamos a utilizar principalmente la página biomodel.uah
biomodel
2. Vamos a instalar el programa y empezamos a dibujar. Vamos a dibujar una glucosa y una fructosa, por ejemplo.
3. En http://www2.uah.es/biomodel/model3j/inicio.htm vamos a poder trabajar con las siguientes moléculas:
Glúcidos
Vamos a buscar un monosacárido, un disacárido y un polisacárido.
Dos aminoácidos
Vamos a insertarlos en el Blog

¿Se podría recuperar el ADN de un dinosaurio?

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Oct 162012
 

En la película Parque Jurásico se conseguía recuperar ADN de dinosaurios de hace de 65 millones de años a partir de la sangre chupada a estos animales por mosquitos conservados en ámbar. Con los fragmentos recuperados y cubriendo los huecos con ADN de rana (debería haber sido con ADN de reptiles o de aves, al menos, actuales) los científicos pudieron “fabricar” dinosaurios.Según las últimas investigaciones esto no sería posible, ya que el ADN tiene un promedio de vida de 521 años.
Según un estudio publicado por Matt Kaplan y la revista Nature parece que el ADN de los dinosaurios y los insectos atrapados en ámbar antiguos no se podrían recuperar para hacer un ‘Jurassic Park’
¿Cómo se ha hecho el experimento?
Se han utilizado los huesos de aves extintas en Nueva Zelanda para calcular la vida media de ADN.

Después de la muerte celular, los enzimas empiezan a romper los enlaces entre los nucleótidos que forman el ADN y los microorganismos aceleran la descomposición. Sin embargo, parece que es el agua la responsable de la degradación y la presencia de agua subterránea es casi omnipresente.
Las dificulatades
-Es raro encontrar grandes conjuntos de ADN suficiente para hacer comparaciones significativas.
-Las condiciones ambientales variables como la temperatura, el grado de ataque microbiano y la oxigenación son capaces de alterar la velocidad de descomposición.

Morten Allentoft en la Universidad de Copenhague y Michael Bunce en la Universidad Murdoch en Perth, Australia, examinaron 158 muestras de 3 especies de aves Moa extintas, que contenían ADN. Los huesos, con 600 y 8.000 años de edad, habían sido recuperados de tres sitios con condiciones de conservación casi idénticos y temperatura de 13,1 º C.

Estudio
Al comparar las edades de los especímenes y grados de degradación del ADN, los investigadores calcularon que el ADN tiene una vida media de 521 años. Vida media significa, al igual que en los estudios de radiactividad, que después de 521 años, la mitad de los enlaces entre los nucleótidos en la doble hélice se habrían roto, después de otros 521 años la mitad de los enlaces restantes se han ido, y así sucesivamente.

El equipo predice que incluso en un hueso a una temperatura ideal de conservación -5 º C, de manera efectiva todos los huesos serían destruidos después de un máximo de 6,8 millones de años. El ADN dejaría de ser legible mucho antes – tal vez después de unos 1,5 millones de años, cuando los filamentos restantes fueran demasiado cortos para dar información significativa.

“Podríamos ser capaces de romper el récord de la secuencia de ADN más antiguo auténtico, que actualmente es de alrededor de medio millón años “, dice Simon Ho, biólogo computacional de la Universidad de Sydney en Australia.
¿Por qué?
Porque quedan interrogantes:
-¿Ocurrirá lo mismo en otros ambientes, como permafrost y las cuevas?
-Analizar la química del suelo e incluso la época del año.

Publicado en Nature el 10 de octubre de 2012.
Aprovecho para ligar la fantástica explicación que se daba en Jurasik Park al ADN y los trabajos de clonación, que parece que estos estudios niegan.

Premios Nobel 2012

 biología, Célula, científicos, Citología e Histología, Genética  Sin comentarios »
Oct 082012
 

Premio Nobel 2012 en Medicina para John B. Gurdon y Shinya Yamanaka por estudios en la reprogramación de células.

Desde hace muchos años se conoce que procedemos de la unión del espermatozoide y el óvulo, del zigoto. Que el zigoto se va dividiendo, en los seres pluricelulares, en múltiples células hijas que contienen la misma información genética, formando la mórula y que después se produce una diferenciación celular, de tal forma que las células se especializan, perdiendo la multipotencialidad que tenía la célula madre, se pensaba que para siempre.

Gurdon fue el primero en demostrar en 1962 que la especialización es reversible. Lo hizo sustituyendo el núcleo de un óvulo de rana por el núcleo de una célula intestinal de rana y consiguiendo que se desarrollara un renacuajo normal. Había “reformateado” el óvulo.

En este caldo de cultivo trabajó Yamanaka, buscando cómo las células madre embrionarias tienen capacidad para convertirse en cualquier tipo celular y trabajando con la hipótesis de que fueran genes los que regularan esa potencia.
Yamanaka descubrió que sólo hacían falta cuatro genes para transformar las células adultas diferenciadas en células madre (las conocidad como células madre plutipotentes inducidas o células iPS)
Su descubrimiento ha permitido salvar las restricciones religiosas al uso de células madre embrionarias y también la disminución del rechazo del posible paciente al injerto de tejidos, por tratarse de células del propio paciente.

Hoy es un gran día, ya se puede vislumbrar un panorama de apertura a posibles curaciones utilizando células propias reprogramadas.

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